Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms