Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC52A3Q9NQ40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms