Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF1Q9H7N4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms