Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms