Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP4Q9C0A0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms