Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPL3Q9BY60 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms