Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms