Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRRTQ9BXP5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms