Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARD11Q9BXL7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms