Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms