Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms