Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms