Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF1Q9BSM1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms