Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms