Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms