Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms