Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms