Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms