Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms