Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PRAC1Q96KF2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms