Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms