Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms