Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP36Q96G28 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms