Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MALSU1Q96EH3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms