Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4CQ96DT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms