Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDAC11Q96DB2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms