Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms