Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPDL3AQ92484 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms