Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF398Q8TD17 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ZNF398Q8TD17 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF398Q8TD17 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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