Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms