Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms