Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD53Q8N9V6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms