Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms