Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms