Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q6Q795 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q6Q795 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q6Q795 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms