Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms