Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF6Q5VXH4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms