Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms