Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOGA3Q5TF21 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms