Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms