Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms