Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms