Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms