Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC93Q567U6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms