Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM16LQ309B1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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