Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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CCDC96Q2M329 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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CCDC96Q2M329 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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