Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms