Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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