Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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