Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms